Филиал Государственного центра современного искусства появился в Екатеринбурге в 1999 году, взяв на себя миссию внедрить современное искусство в общественное пространство города. С 2005 года здесь издавался журнал Zaart, который стал своеобразным печатным «архивом» уральского искусства 2000-х. Была скомплектована и выпущена коллекция видеоарта Урало-Сибирского региона. В 2007 году филиал ГЦСИ стал инициатором первой Ночи музеев в Екатеринбурге.

С 2008 года филиал реализует программу «Уральские заводы: индустрия смыслов», посвященную художественному переосмыслению темы промышленной реальности в городской среде: в рамках этой программы два года подряд в городе проходил международный фестиваль-лаборатория «Аrt-завод». Из этой же программы вырос самый масштабный проект филиала на сегодняшний день – Уральская индустриальная биеннале современного искусства, основанная в 2010 году. Более 100 производственных, выставочных, театральных, образовательных и бизнес-площадок Екатеринбурга и Уральского региона стали участниками биеннале.

С 2011 года Екатеринбургский филиал ГЦСИ получает собственное здание и становится Уральским филиалом и расширяет свою деятельность на Уральский федеральный округ (Свердловская, Курганская, Тюменская, Челябинская области, Ханты-Мансийский и Ямало-Ненецкий автономные округа), а также запускает программу поддержки молодых художников «Мастерская».

Сегодня более десяти проектов УфГЦСИ стали номинантами всероссийской премии в области современного искусства «Инновация». На площадке центра реализуются выставочные проекты, образовательные программы в сфере современного искусства; резиденции и мастерские художников.