История Апшеронского музея начинается в конце 1960-х годов. Динамическое развитие учреждения продолжалось вплоть до начала 1990-х. Во времена государственных изменений фонды были переданы районному казачьему обществу и размещены в четырех залах бывшего атаманского управления. Лишь в 2003 году музею выделено реконструированное здание. Этот год является годом основания музея.

В настоящее время фонд насчитывает более 3,5 тыс. единиц подлинных предметов истории, культуры и изобразительного искусства, археологических, этнографических, военно-исторических и природоведческих коллекций.

Большой интерес у посетителей вызывают коллекции военной тематики, археологии, палеонтологии, истории образования казачества и быта переселенцев, истории развития региона. Историко-культурная специфика региона позволяет аккумулировать в фондах музея совершенно разные направления.

Особое внимание в работе музея уделяется периоду Великой Отечественной войны. На территории региона в годы войны проходили активные боевые действия. Музей обладает высоким потенциалом развития, во многом связанным с новыми технологическими возможностями и увеличением туристического потока в регионе.