История Керченского музея древностей началась с личной коллекции Поля Дюбрюкса (1774–1835) — родоначальника керченской археологии, — основанной в 1810 г. 2 (14 по новому стилю) июня 1826 г. музей был учрежден официально и располагался в доме П. Дюбрюкса до 1833 г. Первым директором музея стал И.П. Бларамберг. С момента создания Керченского музея древностей основным направлением его деятельности являлось изучение и сохранение античных памятников, найденных на Керченском и Таманском полуостровах, то есть на территории древнего Боспорского царства. Значительному развитию археологических работ в Керчи способствовали раскопки богатого кургана Куль-Оба осенью 1830 г.

В семи залах посетители знакомятся с историей Восточного Крыма от палеолита до средневековья. Здесь можно увидеть первые палеолитические артефакты, кремневый неолитический нож в роговой рукояти, металлические орудия эпохи бронзы, менгиры.

Ранний железный век представлен находками из кургана кизил-кобинской культуры и двумя полными археологическими комплексами из Трехбратних курганов.

Ионийская и аттическая расписная керамика, высокохудожественные предметы из кости, дерева, стекла и металла, выдающиеся эпиграфические памятники, изделия местных мастеров знакомят публику с античной культурой Боспорского царства с VI в. до н. э. до IV в. н. э. Средневековые памятники на выставке дают красочную палитру жизни разных народов Таврического полуострова.