В честь великого русского ученого М.В. Ломоносова на его родине в 1940 году был открыт историко-мемориальный музей. 5 ноября 2004 года произошло изменение в названии учреждения. При объединении трех музеев, находящихся на территории Холмогорского района, образовалось муниципальное учреждение культуры «Историко-мемориальный музей М.В. Ломоносова».

Музей занимается научно-просветительской деятельностью, осуществляет комплексное хранение, изучение и популяризацию памятников истории, материальной и духовной культуры. Основной фонд насчитывает 4 859 единиц хранения, научно-вспомогательный — 5 003, книжный фонд библиотеки — 3 038. Дважды полностью менялась экспозиция, вводятся новые материалы и экспонаты, применяется новое музейное оборудование и технические средства.

Здание музея, построенное в 1892 году, окружено тремя пристройками, открытие которых было приурочено к юбилейным датам М.В. Ломоносова. К 290-летию ученого был открыт выставочный зал, где разместились две постоянные выставки — «Холмогорская резная кость» и «Картины северных художников». К 300-летию Михаила Васильевича открылся еще один зал для временных выставок и конференц-зал, где проводятся мероприятия, посвященные М.В. Ломоносову и созданы все условия для желающих самостоятельно изучать жизнь и наследие великого ученого. В этом же помещении разместились музейные фонды и библиотека.