Здание Музея истории Оренбурга было построено во время второго правления оренбургского генерал-губернатора В.А. Перовского (1851–1857 гг.) в таком стиле, как неоготика (или псевдоготика). Историограф Оренбурга П.П. Столпянский писал в XIX веке, что город Оренбург обязан Перовскому построением чуть ли не трех четвертей всех зданий: Караван-сарай, Контрольная палата, Общественное собрание, дом Казенной палаты, казармы — все построено при Перовском. При Перовском было обращено серьезное внимание и на благоустройство города. Все это объяснялось тем, что Василий Алексеевич стремился придать провинциальному Оренбургу облик столичного города. Во время его правления появляются общественные здания и учреждения, строятся каменные дома, входят в моду балы, городские гулянья.

Музей основан в 1983 году. Это событие было приурочено к 240-летию города Оренбурга. Состоит музей из девяти стационарных экспозиций, рассказывающих об истории города с древнейших времен. Выставки раскрывают такие вопросы, как:

• основание города на восточной границе России;
• крестьянская война под предводительством Е. Пугачева;
• Оренбург в первой пол. XIX в.;
• пребывание А.С. Пушкина в Оренбурге;
• архитектура города, этнография;
• управление краем;
• известные люди России – М. Карамзин, Г. Державин, И. Крылов;
• исследователи края — И. Лепехин, П. Паллас, П. Рычков, Э. Эверсман, А. Гумбольдт.